Napaka atrijskega septuma nastane, kadar se v embrionalnem razvoju med desnim in levim preddvorom srca septum primum in septum secundum ne razvijeta pravilno. To povzroči mešanje deoksigenirane krvi s kisikom. Manjše tovrstne napake morda ne povzročajo težav ali simptomov, večje pa se pokažejo z različnimi simptomi. Ta vrsta napake se najpogosteje odkrije v odrasli dobi, običajno pri osebah, starejših od 30 let. Včasih so takšne napake tudi del drugih bolezni, bodisi deformacij v obliki srčnih zaklopk ali različnih genetskih sindromov.
Defekt ventrikularne pregrade je lahko prirojen, lahko pa je tudi pridobljen. Gre za resnejšo težavo, ki se običajno pojavi v otroštvu. V otroštvu lahko nastane zaradi težav v materini nosečnosti, v odrasli dobi pa na primer kot posledica miokardnega infarkta. Pri tej napaki obstaja težnja, da se majhna razpoka spontano zapre. Ta napaka povzroča tudi levo-desni šant, običajno pa jo spremljajo težave s srčnim ritmom in dihanjem.